nema mnogo veze to što si početnik i to što koristiš centos.
Ako hoćeš da koristiš linuks (u pogledu rada sa servisima), moraš malo i teorije da savladaš.
kada aktiviraš određeni servis, recimo vsftpd znaj da ima razlike u odnosu na druge slične servise i da sama konfiguracija bude malo drugačija.
Kod centosa je aktivno chroot-ovanje, tako da ako nisi bio root, bude očekivano da dobiješ virtualni dir, koji je prazan... dakle, dobio si virtualni /var
Firewall je veoma kompleksna stvar, barem za početnika i dobro je da se setuje jedno po jedno pravilo. Npr, za početak nauči kako da otvoriš samo port 80, pa jedno po jedno.
U današnje vreme je barem dokumentacija svuda dostupna, pa je treba koristiti...